卵巢囊肿可分为卵泡囊肿和黄体囊肿。确切原因尚不完全清楚。目前认为，卵巢囊肿可能与内分泌机能失调、促黄体素分泌不足、排卵机能受到破坏有关。
其中炎症性卵巢囊肿是由于输卵管炎症波及卵巢，相互粘连，输卵管峡部梗阻，其伞端又与卵巢之卵泡囊肿穿通使渗液积聚；或输卵管卵巢脓肿，脓液吸收液化而形成炎性囊肿。此脓肿称输卵管卵巢囊肿，非真性卵巢囊肿。
卵巢囊肿是卵巢囊性肿块的统称，它对于身体的危害以及对它的治疗，取决于它的性质。对30岁以上妇女来说，即使无任何不适，每年都应体格检查一次，包括进行妇科检查。如果发现卵巢囊肿，应进一步检查，明确是功能性囊肿，还是肿瘤性的囊肿，以采取不同的治疗方法。
一般来说，如囊肿直径小于5厘米，又无证据提示肿瘤的话，多为功能性囊肿，可以密切随访，即2-3个月检查一次，以后再根据情况调整检查间隔时间；若4-6周后缩小或未增大，则功能性囊肿的可能性较大。
若囊肿继续增大，尤其大于5厘米者，或者突然下腹部阵发性绞痛，可能是肿瘤性囊肿或发生了囊肿扭转或破裂，则应手术探查确定其良恶性，必要时手术切除
