人类妊娠受多方面的影响，当某些因素发生改变时，胎儿随时可能发生意外，出现流产。已知的自然流产的原因可如下几种：
1.遗传基因缺陷。染色体异常，包括在有丝分裂和减数分裂时异位、缺失及倒位，夫妇中有一人是染色体异位携带者， 即可发生反复流产。染色体异常常为染色体数目异常和染色体结构异常。
2.外界的不良刺激。外界不良刺激有化学性的和物理性的。化学性的主要有如下几种：镉，动物试验证实，给妊娠动物一定量的镉，可造成其后代前肢畸形。妇女职业上接触镉的，婴儿体重往往较低。有机汞，对孕妇影响较大，长期接触大剂量的甲基汞、苯酚汞时，其胎儿产生毒性反应或畸形发育。有机汞易聚集在中枢神经系统，特别是大脑中，影响胎儿智力发育。铅，对人类和动物均有害。铅损害性腺功能，容易导致胚胎畸形。二溴氯丙烷不仅可致畸形还可致癌，二硫化碳影响卵巢功能，增加流产率和早产率。麻醉气体中的一氧化碳对生殖有害。吸烟过多可致胎儿先天性畸形或流产。另外，镍、乙烯基氯、氯丁二烯、滴滴涕等均可导致胎儿畸形、流产、早产。在物理因素中，首害为放射物质。它可导致自然流产、新生儿死亡、增加小头畸形及先天愚型发生率。妊娠4-11周时，如果放射性物质剂量越过2.5/GY，则可导致胎儿发生中枢神经畸形，12?9周则可发生智力迟钝，即使小剂量的放射诊断，也可能增加下一代发生白血病的危险。噪声和震动，可使胎儿早期流产、死亡率增加、听觉器官损害。流行病学的调查结果表明，工业噪声和农业噪音较大时，对妇女生育能力、内分泌功能、月经周期等均有不良影响。高温、微波对胎儿有害。之外，重体力劳动、外伤、剧烈活动、闪挫对胎儿同样有不良影响。
3.母体因素。母体虚弱、或有严重疾病，严重贫血，营养不良，严重的急性传染病，沉重的精神创伤，情绪不稳定等因素均易导致流产。母体生殖道畸形，各类型子宫畸形，尤其是形态畸形，子宫肌瘤等，均可因宫腔不宜而胎儿短命。宫颈闭锁不全，有先天性的和继发性的。继发性的多由于频繁扩张宫颈及刮宫造成宫颈撕裂，或子宫颈做过切除术，或急产、产钳、胎头吸引产时造成宫颈撕裂，胎儿难以生长在宫腔。黄体功能不全，可造成子宫内膜发育迟缓和黄体期短，故而影响受精卵的种植，或早期妊娠发生流产。黄体功能不全者常伴其它腺体功能异常。如泌乳素过高，甲状腺功能减低，肾上腺分泌雄激素过多等。些因素均不利于胎儿发育。胎盘内分泌功能不足也是流产的常见因素。当胎盘分泌的绒毛膜促性腺激素、胎盘泌乳素、孕酮、雌酮等激素偏低时，5%妊娠者将发生流产。如同时伴出血者，则80%?0%胎儿夭亡。子宫内膜异位症难于妊娠，即使妊娠也易流产，因该类膜腔中的前列腺水平增高，常引起早孕流产。免疫性因素也是流产的常见原因。正常妊娠时母体对滋养层细胞抗原就有免疫反应，若母体血清中缺乏阻断因子或阻断抗体时，则易发生流产。抗精子抗体(AsAb)阳性者也易反复流产。ABO 血型不合，也是流产的常见类型。
4.男性因素。这是以往容易被忽略的因素。据临床观察，其父菌精症，约占10%?5%。男性生殖道内无症状的感染精液中，即含有一定数量的细菌、病毒、沙眼衣原体、脲原支原体等，这些感染可削弱受孕妇女的孕育能力，而致使胚胎流产。活动的精子在完成"生命之吻"时也会将细菌带去，这就会干扰精卵结合与着床。所带的细菌，多为粪链球菌、白色葡萄球菌、大肠杆菌、厌氧性细菌等。
