生殖器念珠菌病分为念珠菌性阴道炎和念珠菌性龟头炎。两者与性行为关系密切，可以通过性行为互相传播。
念珠菌性阴道炎 (candidal vaginitis) ，又称外阴阴道念珠菌病 (vulvovaginal candidiasis, VVC) ，是由阴道内的念珠菌，主要为白色念珠菌引起的阴道及外阴的炎症性疾病。
临床以典型的豆腐渣样白带及剧烈的外阴瘙痒为特征。急性发作的病人如果治疗不彻底则容易转为慢性复发性念珠菌性阴道炎（ RVVC ）。
念珠菌性龟头炎是念珠菌引起的男性包皮龟头的炎症。
